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复旦AI for Science团队造“履行神器”:显微镜秒变高清相机

发布日期:2024-04-15 00:03    点击次数:152

无用最腾贵的镜头,也能拍出高清相片。

比年来,濒临东谈主们快速增多的影像昭彰度需求,繁多手机、数码相机厂商贬抑探索如安在限度本钱的情况下,使用AI模子进一步进步像素级。这一次,相通的时刻理念,却被复旦大学计较机科学时刻学院教育颜波携带的团队,迁徙到了人命科学履行室里的常用磋磨器具“荧显豁微镜”上。

4月12日,科学期刊《当然-时局》(Nature Methods)以《基于广义荧显豁微镜的图像还原的预检修基础模子》(Pre-training a Foundation Model for Generalizable Fluorescence Microscopy-Based Image Restoration)为题刊发团队结果,他们发明的跨任务、多维度图像增强基础AI模子(UniFMIR),杀青了对现存荧显豁微成像极限的顽固。

荧显豁微镜图像增强基础模子(UniFMIR)架构。复旦大学 供图

何为荧显豁微镜?这类显微镜期骗部分物资受紫外线照耀后可发荧光的特质,以及通过染色让本不具有该特质的物资发出荧光,不错不雅察细胞内物资的领受、输送、化学物资的踱步及定位等。在区分率方面,它远超世俗光学显微镜0.2微米极限,到达不雅测分子的纳米次第,是人命科学领域不成或缺的磋磨器具。自2006年横空出世,荧显豁微镜已匡助大师科学家研制出了对帕金森氏症、阿尔茨海默氏症和亨廷顿氏症等神经退行性疾病更有针对性的治疗时局。

尽管荧显豁微镜的不雅测区分率已达到纳米次第,但科学家们并不餍足于此。

由于显微镜光学硬件和生物样本光敏锐性(在荧光照耀下,生物活性裁减)带来的挑战,往日几年中,人命科学和计较机领域的科学家们运行联袂探索用AI的旅途来增强图像质料的主张。可是,成像景色各样、降质类型复杂、增强过程迥异等一系列问题,使得这一任务极具挑战性,股票配资平台选哪个于是,大无数科学家采用“每次惩处一个问题”,聚焦于研制针对单一需求的“特有”AI模子。

来自复旦大学的这支AI for Science团队则采用直击挑战,以“一站式集成”为诡计,径直构建了首个“息争”的荧显豁微镜图像增强AI基础模子(UniFMIR),大幅进步在“图像超区分率重构、各向同性重构、3D去噪、图像投影和过程重建”五大任务方朝上的性能。

UniFMIR接收了基于Swin Transformer结构的特征增强模块来增强特征暗意,针对不同任务的齐集进程分享研究的特征增强计较。通过网罗的大边界数据集对模子进行预检修,并使用不同图像增强任务的数据微调模子参数,UniFMIR展现出比特有模子更好的增强性能和泛化性。

这意味着,加载了UniFMIR的荧显豁微镜可能成为人命科学履行室中的“神器”。

科学家们能更昭彰地不雅察到活细胞里面的轻微结构和复杂过程,加快大师人命科学、医学磋磨、疾病会诊关系领域的科学发现和医疗立异;同期,在半导体制造、新材料研发等领域,该结果不错用来进步不雅察和分析材料微不雅结构的质料,从而优化制造工艺和提高家具性量。

UniFMIR的见效研发象征着中国在要道科学仪器领域“国产成就+基础模子”的组合能有用减少对入口成就的依赖,也为大师科研领域的进取孝顺了中国贤慧和力量。

复旦大学计较机科学时刻学院数字媒体履行室成员。复旦大学 供图

“此次咱们念念到把AI图像增强时刻应用于荧显豁微镜上,并构建UniFMIR,起点等于AI for Science。咱们的模子为荧显豁微镜图像增强提供了一个通用的惩处决策,通过通俗的参数微调便可应用于不同任务、成像景色和生物结构。畴昔,人命科学履行室的科学家们可通过进一步推广检修数据的数据量和丰富度来贬抑强化UniFMIR的图像重构才气。”颜波对UniFMIR被用于更多类型履行的可能性充满信心。

该项磋磨由复旦大学计较机科学时刻学院数字媒体履行室完成。履行室博士后马晨光博士和后生磋磨员谭伟敏博士为该职责的共同第一作家,颜波为通信作家,其他作家还包括履行室博士生何瑞安。该磋磨职责取得国度当然科学基金委和上海市科委边幅资助。



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